أعطى أمير منطقة المدينة المنورة فيصل بن سلمان بن عبد العزيز آل سعود الأوامر بإطلاق اسم الشيخ محمد الأمين الجكني الشنقيطي على أحد الشوارع الرئيسية بـالمدينة المنورة تكريماً وتخليداً لمسيرته العلمية والعملية في خدمة العلوم الشرعية.
كما دشن الأمير كرسياً بحثياً في الجامعة الإسلامية يحمل اسم الشيخ محمد الأمين الجكني الشنقيطي، عالم التفسير ومؤلف أضواء البيان في تفسير القرآن بالقرآن، المتوفى منذ 50 عاماً.